Útil para principiantes
Las comillas mágicas son implementadas en PHP para ayudar a que el código escrito por principiantes no resulte peligroso. Aunque la Inyección SQL es posible aun con las comillas mágicas habilitadas, el riesgo es reducido.
Conveniencia
Para insertar datos en una base de datos, las comillas mágicas básicamente usan addslashes() sobre todos los datos Get, Post, y Cookie, y lo hace automáticamente.